Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAMP11215 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms