Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TOP1MT-205ENST00000518760 613 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRA2-205ENST00000509433 573 ntTSL 215.03■□□□□ -08e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HCLS1-207ENST00000481314 1069 ntTSL 215.02■□□□□ -08e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIF1BP-212ENST00000637420 2260 ntTSL 515.02□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF31-214ENST00000559449 808 ntTSL 515.01□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBC1D14-209ENST00000467966 627 ntTSL 315.01□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK7-206ENST00000461100 546 ntTSL 415□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMAD3-214ENST00000560402 590 ntTSL 414.99□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CDC34-207ENST00000607527 357 ntTSL 514.98□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NBAS-206ENST00000433283 687 ntTSL 214.98□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.96□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 514.96□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NPTN-210ENST00000567198 571 ntTSL 414.95□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RABGGTA-212ENST00000559974 1963 ntTSL 514.93□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ALAS2-205ENST00000463868 646 ntTSL 314.92□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARPC1B-210ENST00000445924 727 ntTSL 514.91□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SAMD11-204ENST00000437963 387 ntTSL 514.86□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC004997.1-203ENST00000434291 1818 ntAPPRIS P1 TSL 214.86□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 214.83□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MKS1-203ENST00000393120 1926 ntTSL 214.82□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARPC1B-208ENST00000432343 839 ntTSL 514.81□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ITPK1-209ENST00000556185 691 ntTSL 514.8□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-211ENST00000567411 1743 ntTSL 514.79□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.79□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADCK1-205ENST00000555333 600 ntTSL 414.79□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ELMSAN1-203ENST00000421708 558 ntTSL 414.79□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 107
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SF3B1O75533 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 214.78□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-208ENST00000535587 548 ntTSL 514.78□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DEAF1-203ENST00000525626 585 ntTSL 314.77□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 107
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SF3B1O75533 CASP8-215ENST00000444430 1275 ntTSL 514.72□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CYB5R3-207ENST00000466276 581 ntTSL 414.69□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WNT7A-202ENST00000489346 401 ntTSL 314.69□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
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SF3B1O75533 MEG3-207ENST00000424076 2672 ntTSL 514.69□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 214.69□□□□□ -0.066e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTLL7-207ENST00000474957 7157 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 414.61□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIAA1191-207ENST00000506668 741 ntTSL 214.61□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AP1G1-217ENST00000569185 559 ntTSL 314.6□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-208ENST00000567027 1353 ntTSL 214.57□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIH1D1-219ENST00000600875 633 ntTSL 514.56□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-217ENST00000450491 686 ntTSL 314.56□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FOS-210ENST00000557139 249 ntTSL 514.55□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FOS-207ENST00000555672 834 ntTSL 214.53□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 214.53□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD52-208ENST00000481052 2464 ntTSL 214.52□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-217ENST00000482261 1149 ntTSL 514.51□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-221ENST00000494767 1023 ntTSL 514.51□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPG7-221ENST00000569720 909 ntTSL 214.5□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 APEH-214ENST00000482301 1041 ntTSL 314.5□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 214.5□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 107
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