Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHF1O43189 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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