Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms