Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-1B6SEH8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms