Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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