Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms