Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF1Q9UH73 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms