Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms