Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms