Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms