Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC35C2Q9NQQ7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC35C2Q9NQQ7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms