Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC52A3Q9NQ40 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms