Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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