Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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