Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VN1R1Q9GZP7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms