Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3CQ9BUI4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms