Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM43Q9BTV4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM43Q9BTV4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms