Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms