Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms