Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms