Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms