Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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