Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PGLYRP3Q96LB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGLYRP3Q96LB9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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