Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINGO1Q96FE5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms