Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms