Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms