Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHIPQ8WWQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms