Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms