Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVOPQ8N4V2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms