Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAG1Q86YV5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAG1Q86YV5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms