Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms