Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms