Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms