Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ATP6V1FQ16864 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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