Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms