Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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