Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TLR1Q15399 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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