Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms