Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms