Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTCH1Q13635 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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