Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms