Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PRKAA1Q13131 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PRKAA1Q13131 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKAA1Q13131 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PRKAA1Q13131 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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