Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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TRAF1Q13077 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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TRAF1Q13077 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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TRAF1Q13077 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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