Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms