Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRMPQ12912 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRMPQ12912 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms