Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABPB1Q06547 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms