Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms