Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms