Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IFITM3Q01628 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms